Budžeta plānošanā uzņēmējdarbībā ir vairāki trūkumi, kas ir šādi:
Nepieciešamais laiks. Budžeta izveide var būt ļoti laikietilpīga, īpaši slikti organizētā vidē, kur var būt nepieciešami daudzi budžeta atkārtojumi. Iesaistītais laiks ir mazāks, ja ir izveidota labi izstrādāta budžeta veidošanas procedūra, darbinieki ir pieraduši pie šī procesa un uzņēmums izmanto budžeta plānošanas programmatūru. Laika prasība var būt neparasti liela, ja ir izveidots līdzdalīgs budžeta veidošanas process, jo šajā sistēmā iesaistīts liels skaits darbinieku.
Spēļu sistēma. Pieredzējis vadītājs var mēģināt ieviest budžeta kavēšanos, kas ietver apzinātu ieņēmumu aprēķinu samazināšanu un izdevumu tāmes palielināšanu, lai viņš varētu viegli panākt labvēlīgas novirzes no budžeta. Tā var būt nopietna problēma, un tās novērošana un novēršana prasa ievērojamu uzraudzību.
Vainot par rezultātiem. Ja nodaļa nesasniedz budžetā paredzētos rezultātus, nodaļas vadītājs var pārmest citiem departamentiem, kas tai sniedz pakalpojumus, par to, ka viņš nav pienācīgi atbalstījis viņa nodaļu.
Izdevumu sadalījums. Budžets var noteikt, ka noteiktas pieskaitāmo izmaksu summas jāpiešķir dažādām nodaļām, un šo departamentu vadītāji var apstrīdēt izmantotās sadales metodes.
Tērē vai pazaudē. Ja nodaļai ir atļauta noteikta izdevumu summa un šķiet, ka departaments budžeta periodā iztērēs visus līdzekļus, nodaļas vadītājs pēdējā brīdī var atļaut pārmērīgus izdevumus, pamatojot to ar to, ka viņa budžets tiks samazināts nākamajā periodā, ja vien viņš neiztērē visu atļauto pašreizējā budžetā.
Tiek ņemti vērā tikai finanšu rezultāti. Budžets galvenokārt ir saistīts ar skaidras naudas piešķiršanu konkrētām darbībām un paredzamo biznesa darījumu iznākumu - tie nenodarbojas ar subjektīvākiem jautājumiem, piemēram, klientiem piedāvāto produktu vai pakalpojumu kvalitāti. Tas neietver arī pārskatu par riskiem, kas pakļauti uzņēmējdarbībai. Šos pārējos jautājumus var norādīt kā daļu no budžeta, bet tas parasti netiek darīts.
Stratēģiskā stingrība. Kad uzņēmums izveido gada budžetu, augstākās vadības komanda var nolemt, ka organizācijas uzmanība nākamajam gadam pilnībā tiks vērsta uz budžetā noteikto mērķu sasniegšanu. Tā var būt problēma, ja tirgus kaut kad budžeta gada laikā mainās citā virzienā. Šajā gadījumā uzņēmumam būtu jāmainās kopā ar tirgu, nevis jāievēro budžets.
