Kontroles sistēma nesniedz pilnīgu pārliecību, ka tiks sasniegti organizācijas kontroles mērķi. Tā vietā jebkurai sistēmai ir vairāki raksturīgi ierobežojumi, kas samazina pārliecības līmeni. Šie raksturīgie ierobežojumi ir šādi:
Slepenā vienošanās. Divi vai vairāki cilvēki, kuriem kontroles sistēma ir paredzēta, lai viens otru uzraudzītu, tā vietā varētu sadarboties, lai apietu sistēmu.
Cilvēka kļūda. Kontroles sistēmā iesaistītā persona varētu vienkārši kļūdīties, varbūt aizmirstot izmantot kontroles soli. Vai arī persona nesaprot, kā jāizmanto vadības sistēma, vai nesaprot ar sistēmu saistītās instrukcijas. To var izraisīt nepareizas personas norīkošana uzdevumam.
Pārvaldība ignorē. Kāds no vadības komandas, kuram ir pilnvaras to darīt, viņa personīgo priekšrocību labad varētu ignorēt jebkuru kontroles sistēmas aspektu.
Trūkst pienākumu nošķiršanas. Kontroles sistēma, iespējams, ir izstrādāta ar nepietiekamu pienākumu nošķiršanu, lai viena persona varētu traucēt tās pareizu darbību.
Līdz ar to ir jāpieņem, ka neviena iekšējās kontroles sistēma nav perfekta. Vienmēr ir veids, kā tas var neizdoties vai to var apiet.
